สำนักงานสาธารณสุขอำเภอท่าตูม มีกลุ่มงานอยู่ 3 กลุ่มงานหลักได้แก่

1.กลุ่มงานบริหารงานทั่วไป

- กลุ่มงานบริหารทั่วไป

- งานการเงินและบัญชี

- งานการเจ้าหน้าที่

- งานยุทธศาสตร์

- ICT

- งานนิติการ

- งาน ITA ชมรมจริยธรรม

- งานประกันสุขภาพ

- งานพัฒนาคุณภาพบริการ

- งานสุขภาพภาคประชาชน

- งานพัฒนาพฤติกรรมสุขภาพ

- งานพัฒนาบุคลากร

- งานรักษาพยาบาลเฉพาะกิจและจิตอาสา

- งานส่งเสริมสุขภาพ

-งานสุขภาพจิต

- งานยาเสพติด

- งานอาหารปลอดภัย

- งานอนามัยสิ่งแวดล้อม

- งานควบคุมโรคติดต่อ

- งานควบคุมโรคไม่ติดต่อ

- งานการแพทย์ฉุกเฉิน

- งานเบาหวาน/ความดันโลหิตสูง

- มะเร็ง

- งานควบคุมการบริโภคบุหรี่สุรา

- งานคุ้มครองผู้บริโภค

- งานทันตสาธารณสุข

-งานแพทย์แผนไทย